Фильмы рассказывают о мутантах, обладающих уникальными способностями, которые борются за свои права и выживание в мире, где их ненавидят и боятся. Под руководством профессора Чарльза Ксавьера они учатся контролировать свои способности и защищать мир. Но могущественный мутант Магнето и его команда не верят в мирное сосуществование людей и мутантов и готовы захватить власть над миром. Вторая часть фильма рассказывает о новой угрозе, которая заставляет мутантов бороться за свою жизнь и свободу.